逗比天团回归，解开星爵身世之谜
在1980年的地球，主角星爵的父亲伊戈正开着跑车泡妞，而这个美丽大方的女孩正是星爵的母亲。随后他们来到树林里，给她看他种下的神秘种子，说不久后它将会遍布全宇宙。回到现在的时间线，银河护卫队受至高星大祭司阿耶莎委托，剿灭前来吞噬至高星能量电池的外星怪兽。忽然一声嘶吼，一个形如八爪章鱼的怪兽张开大獠牙从天而降，星爵一行人穿着飞行服展开360度无死角的攻击，怎奈怪兽皮肤太厚，火箭浣熊的枪火很难造成对它的伤害。最后卡魔拉找出怪兽脖子上的伤口，拿着匕首用力划开它的肚皮，消灭怪兽的任务圆满完成。
银河护卫队随后来到至高星宏伟的大殿里，大祭司阿耶莎对他们一一进行嘉奖。就在卡魔拉上前向大祭司要报酬时，大祭司把同样前来偷电池的星云带了出来，自认理亏的卡魔拉只能以带走她视作报酬。
不过在离开之前，调皮的火箭浣熊还是偷顺走几枚能量电池，一行人驾驶飞船离开，但飞船还没到至高星的引力范围外，就有大批无人飞船冲了过来。星爵这才发现是火箭偷电池导致被至高星军队追杀，但只能和火箭一起努力控制飞船，躲避至高星攻击，同时穿越小行星带。就在他们即将飞出小行星带时，没料到原来已经有大批无人机在这里，预谋要对他们一网打尽，危急时刻突然冒出两道白光闪过将至高星飞船团灭。
一脸懵逼的火箭看见有一个人站在飞船上向他们招手致意，最终他们的飞船成功飞出小行星带，降落在一颗神似地球的星球上。就在星爵和火箭拌嘴时，刚刚见过的那艘飞船缓缓降落到这里，从舱门走出一个年纪大的男人，声称是星爵的父亲——伊戈，站在他旁边的是一个头上有两只触角的螳螂女，有通过触摸对方感知情绪的能力。
到了晚上，众人坐在篝火旁，伊戈表达对星爵多年来的思念，当年他雇勇度找回星爵，没想到勇度却擅自把星爵留在身边，直到听说有个地球人握住无限原石并且幸存下来，这才确认星爵是自己的儿子，所以找了过来。伊戈邀请星爵去自己的星球，因为只有他和螳螂女孤零零居住在那里。于是格鲁特宝宝陪着火箭留下修复飞船，并看住星云，剩下的人则一起前往伊戈的星球。
就在星爵离开的当天晚上，受雇于大祭司的勇度带领手下前来抓捕，火箭立马触发布在飞船周围设下的陷阱，然而最终不敌被抓了起来。此时的劫掠者内部却先发生内讧，一边是勇度想放银河护卫队一马，一边是勇度手下的一些人认为勇度一味偏袒星爵，却不重视其他人利益。就在双方把枪对峙，突然勇度头上的指挥器被星云从背后开枪给击碎，随后晕倒在地，没了动力的飞箭也掉落在身旁。
原本属于勇度的飞船上被反对党占有，而支持勇度的人都被丢到太空上处死。勇度和火箭被关在牢笼里，格鲁特宝宝也不得不成为反对党的宠物。而恨透了父亲灭霸以及姐姐卡魔拉的星云只想一心报仇，灭霸为了训练这两个养女，就让她们从小自相残杀，每次卡魔拉都是赢，而每次输了的星云身体就会被卸掉一部分换成机械，尽管这样也依然不是姐姐的对手。随后星云要了一艘飞船准备前往伊戈星球找卡魔拉，此时格鲁特宝宝来到火箭和勇度所在的牢笼里，勇度让格鲁特宝宝去飞行员休息室找出备用的指挥器，只有这样勇度就能重新指挥飞箭并杀出重围。最后在勇度的手下柯蒂斯帮助下拿到指挥器，很快他们二人在飞船上对反对党大杀特杀，并将飞船给爆炸。
很快勇度驾驶一艘从飞船分离出来的飞行器驶向伊戈星球。画面切换到另一边，星爵一行人正欣赏着美轮美奂的伊戈星球，随后众人来到大厅，伊戈介绍起自己的身世，在几百万年前，他有了控制周围粒子的能力，开始建起这个星球，能力也随之强大，遗憾的是没有同类。于是他按照人类的模样给自己造一副皮囊，开始在星际间游走，直到认识星爵的母亲，等到有了爱情结晶却不得不离开，因为长时间离开自己的星球会让能量枯萎。
星爵相信了，并且在伊戈的引导下感受到体内蕴含的天神力量，卡魔拉却觉得事有蹊跷，和星爵吵了一架后独自来到城堡外的荒原散步，就在这时星云驾驶飞船冲了过来，二人一直打来打去来到山洞中，大战一番后的姐妹俩才终于倾诉心声并和好如初。很快她们发现山洞里有成堆的尸骨，隐约觉得不对劲，于是赶回城堡逼问螳螂女，这才知道伊戈的阴谋，急忙联系火箭过来救急。
火箭也从勇度口中得知伊戈的本性，循着卡魔拉发出的信号加速赶来。伊戈正给星爵洗脑，作为天神可以创造任何东西，甚至领导整个宇宙。随后伊戈渐渐露出真面目，原来伊戈起初寻找生命的时候，发现所以生命是如此短暂且脆弱，不是他要找的同类，在过去几万年里，伊戈在无数星球上植入分身，目的就是为了消灭并替换掉那些蝼蚁般的生物，然而凭他一人之力无法做到，需要有人帮忙。于是他把自己的基因与其他种族的基因进行嫁接，培养后代成为自己的得力助手，星爵也是其中之一，等孩子们出世后就会雇勇度把孩子送到着来，只是那些后代没有得到天神之力，就会被扔到山洞中，直到听闻星爵获有天神之力。
留有人类思维的星爵问他为何抛下母亲，伊戈表示星爵母亲曾是他的至爱，但害怕耽误大业就将肿瘤植入星爵母亲的大脑，彻底清醒过来的星爵悲愤不已，拔出枪支将伊戈的肉体打碎，然而神力很快让伊戈恢复原样，并控制住星爵，试图让他成为提供神力的电池。就在这时，勇度众人赶到救走了星爵。螳螂女告诉他们要消灭伊戈只有炸毁星球的核心，也就是伊戈的大脑。星爵驾驶着陆舱冲出城堡，直直地向地下前进，要去炸毁伊戈星球的核心。
他们终于到达地下深处，找到了核心，可却被厚厚的岩石包围着，激光进行到一半时，异常记仇的至高星军队再次前来追杀，好在火箭用能量电池做出小型炸弹，并让格鲁特宝宝潜入送到伊戈的核心内部引爆。此时伊戈的能量体也来到了地心，虽然星爵一行人打不过伊戈的能量，但唯一的优势就是核心内部的那颗即将爆炸的炸弹。伊戈星球随着爆炸即将毁灭，伊戈这才感到害怕，试图说服星爵阻止爆炸，因为自己死了那么星爵也就会变成凡人，不再拥有神力。但星爵还是坚决消灭伊戈，他并不在乎神力，只有家人才是他最在意的。
炸弹爆炸后，随着伊戈的死导致整个星球都在崩塌，这时穿着飞行服的勇度带星爵飞了出来，在快接近太空时勇度却把唯一的飞行服给了星爵，自己则在冰冷寂静的银河中慢慢结成了冰块。之后勇度的葬礼在飞船上举行，不曾被当做好人的勇度却成了英雄和真正意义上的父亲。劫掠者联盟在得知勇度的英雄壮举后，纷纷赶来为勇度送行。
其实，影片故事当中最精彩的角色不是星爵也不是小浣熊，也不是萌点爆炸的格鲁特，而是勇度，是第一部的小反派，第二部的泪点担当。这位蓝皮肤红眼睛牙齿有些吓人的掠夺者，他的飞船上却摆满了星爵留下的许多有趣玩偶。因为从地球上带走星爵却没有还给星爵亲生父亲而被自己的同行误解，又因为偏袒星爵而被自己的下属背叛，甚至叛逆的星爵偶尔也会和自己对抗。
直到生命最后一刻，勇度把仅有的飞行服给了星爵，以牺牲自己的生命终于将星爵救了出来。其实最感人的一幕就是勇度和星爵的深情对望，明明有千言万语却无法说出口，只想最后看一看自己的“儿子”，能记住星爵的样子，希望星爵以后活得更好，意义上的父亲就是如此。勇度的葬礼开始时，全场笑声不再，死一般的寂静，当掠夺者的烟花亮起，Father and Son 音乐也随之响起，勇度最后还是获得了所有人的尊重。
